Algorithmic Bioinformatics (19710)

Terms
  1. Algorithmic Bioinformatics - WS09/10
  2. Algorithmic Bioinformatics - WS13/14
  3. Algorithmic Bioinformatics - WS15/16 - Praktikum

Die Vorlesung gibt einen breiten Überblick über die Kerngebiete der Bioinformatik wie Genvorhersage, Sequenzanalyse, Protein Klassifikation, etc. Sie ist die zentrale Veranstaltung des Bachelor Studienganges und legt somit auch die Grundlagen zu einer entsprechenden thematischen Vertiefung im Masterstudiengang.

Themen:

  • Fortgeschrittene Algorithmen für paarweises und multiples Alignment
  • Praktische Datenbanksuchalgorithmen und Filterverfahren
  • Statistische Signifikanz von Sequenzähnlichkeit und Ergebnissen von Datenbanksuchen
  • Statistische Signalanalyse mittels (hidden) Markov Models, Anwendungen in Mustersuche und Genvorhersage
  • Algorithmen zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume
  • Algorithmen zur Kartierung und Sequenzierung von Genomen
  • Algorithmen zur RNA-Strukturvorhersage und RNA-Vergleich
  • Modelle und Algorithmen zur Proteinstruktur-Analyse
  • Auswertung von Daten aus aktuellen Technologien der funktionellen Genomik